153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6862 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6862  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
111 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1981  alkylhydroperoxidase  83.78 
 
 
113 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.893861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  56.76 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  56.76 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  55.56 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  51.35 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  51.35 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.35 
 
 
112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  55.14 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  56.76 
 
 
113 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  51.35 
 
 
114 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.27 
 
 
109 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  54.37 
 
 
114 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  53.4 
 
 
117 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  53.85 
 
 
109 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  53.85 
 
 
109 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.85 
 
 
114 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.85 
 
 
109 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  53.85 
 
 
109 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  53.85 
 
 
109 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  49.07 
 
 
115 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  52.88 
 
 
108 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
113 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
113 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 
113 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
113 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
113 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.43 
 
 
113 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  52.43 
 
 
114 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.43 
 
 
114 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.82 
 
 
111 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.82 
 
 
111 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.06 
 
 
122 aa  97.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  49.04 
 
 
119 aa  97.1  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  47.12 
 
 
115 aa  94  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  61.54 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  70.31 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  44.23 
 
 
115 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.87 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
126 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.81 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.74 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.61 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  38.6 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  42.34 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.54 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  37.27 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  64.2 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4422  alkylhydroperoxidase  38.71 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.48 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  34.82 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  46.38 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  34.41 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.53 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  41.86 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  42.35 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.18 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4083  hypothetical protein  35.51 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430645  normal  0.0288614 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  32.43 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.48 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3867  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  37.23 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.275724  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4173  alkylhydroperoxidase  37.23 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00545824  normal  0.150434 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.23 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  53.33 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.11 
 
 
117 aa  67  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4981  alkylhydroperoxidase  38.1 
 
 
109 aa  67  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  46.38 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2969  hypothetical protein  34.38 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  35.79 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.05 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  30.56 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.26 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  32 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  32 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  30.19 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3748  alkylhydroperoxidase  38.53 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359382  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  37.11 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.13 
 
 
211 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.94 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.94 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  34.82 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.68 
 
 
203 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  32.67 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 
101 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.41 
 
 
117 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  38.55 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0352  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.23 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  38.82 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.63 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  27.52 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  40.96 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  39.02 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  45.31 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>