107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3853 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 		 192 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0666  uncharacterized peroxidase-related enzyme  54.26 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240929  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.57 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  44.57 
 
 		 191 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.72 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  44.02 
 
 		 196 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.68 
 
 		 196 aa  164  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.68 
 
 		 197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  42.78 
 
 		 199 aa  164  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.68 
 
 		 197 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.26 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.65 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  43.62 
 
 		 197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.26 
 
 		 196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.09 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  43.72 
 
 		 197 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.08 
 
 		 398 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.78 
 
 		 386 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.78 
 
 		 369 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.78 
 
 		 369 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.08 
 
 		 372 aa  124  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.18 
 
 		 371 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40 
 
 		 377 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.1 
 
 		 372 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05610  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  37.97 
 
 		 197 aa  114  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.74 
 
 		 377 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  37.91 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.43 
 
 		 210 aa  111  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4848  hypothetical protein  41.3 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1051  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.5 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4899  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.25 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.43 
 
 		 472 aa  92.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.89 
 
 		 396 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  36.89 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  35.38 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  28.81 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.92 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.89 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  30.72 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.43 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  27.15 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  33.05 
 
 		 426 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.25 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  33.05 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.09 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.45 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.65 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.43 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  27.65 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  32.2 
 
 		 426 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.71 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  32.48 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.71 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.45 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.07 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.71 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.57 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.21 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.59 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  26.97 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  27.21 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.45 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.97 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  26.29 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  27.54 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.67 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.36 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.81 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  26.32 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  25.49 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.09 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  26.09 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.09 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.09 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.43 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.24 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.36 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  24.34 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  35 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  29.66 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.85 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.17 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.91 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.32 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.96 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.5 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  26.37 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.07 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.17 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.75 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.81 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.86 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.35 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  28.18 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.81 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>