126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1051 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1051  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 
195 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  70.11 
 
 
200 aa  274  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4848  hypothetical protein  64.92 
 
 
202 aa  235  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05610  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  64.13 
 
 
197 aa  228  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429163  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4899  uncharacterized peroxidase-related enzyme  59.69 
 
 
202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  60.64 
 
 
210 aa  213  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.3 
 
 
472 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  51.03 
 
 
377 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.77 
 
 
371 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50 
 
 
377 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50 
 
 
372 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.69 
 
 
372 aa  168  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  45.63 
 
 
391 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.29 
 
 
204 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.85 
 
 
386 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  42.62 
 
 
196 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  38.8 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.31 
 
 
398 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.01 
 
 
196 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.11 
 
 
369 aa  131  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.11 
 
 
196 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.56 
 
 
369 aa  130  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.56 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.98 
 
 
197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.98 
 
 
197 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  40.44 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  41.85 
 
 
197 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.91 
 
 
195 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.08 
 
 
196 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.89 
 
 
197 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  37.36 
 
 
197 aa  121  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.5 
 
 
192 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0666  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.17 
 
 
191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240929  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.52 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.52 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.11 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.21 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.38 
 
 
396 aa  64.7  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.12 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.36 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.29 
 
 
196 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.46 
 
 
228 aa  62.4  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  33.06 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  29.94 
 
 
201 aa  61.6  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.15 
 
 
198 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.36 
 
 
202 aa  61.6  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.15 
 
 
193 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.15 
 
 
193 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.15 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.06 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.15 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.41 
 
 
190 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  28.57 
 
 
209 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  26.43 
 
 
194 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.09 
 
 
191 aa  58.2  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.63 
 
 
192 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  27.41 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  30.17 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  28.89 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.85 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  28.45 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  30.72 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.72 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.72 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.91 
 
 
172 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  28.89 
 
 
192 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.78 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  30.36 
 
 
214 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.89 
 
 
201 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  29.63 
 
 
194 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.48 
 
 
196 aa  55.1  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.93 
 
 
207 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  28.18 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  29.63 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.15 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  26.19 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.93 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.63 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.5 
 
 
209 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.41 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.9 
 
 
176 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  31.11 
 
 
172 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0195  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.06 
 
 
178 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31 
 
 
181 aa  51.2  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.09 
 
 
192 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.09 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  31.45 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  27.41 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.41 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.77 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  27.05 
 
 
426 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  27.05 
 
 
426 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  26.09 
 
 
202 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  31.11 
 
 
172 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.2 
 
 
192 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  27.05 
 
 
426 aa  48.5  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  31.53 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8777  peroxidase family protein  29.75 
 
 
186 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.39 
 
 
181 aa  48.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>