106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05610 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05610  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  100 
 
 
197 aa  400  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.43 
 
 
472 aa  258  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  62.5 
 
 
200 aa  229  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1051  uncharacterized peroxidase-related enzyme  64.13 
 
 
195 aa  210  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4848  hypothetical protein  59.04 
 
 
202 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4899  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.66 
 
 
202 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.54 
 
 
210 aa  180  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  49.74 
 
 
371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.7 
 
 
377 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  47.64 
 
 
377 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.88 
 
 
372 aa  151  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.32 
 
 
372 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.49 
 
 
196 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40 
 
 
204 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  41.79 
 
 
391 aa  127  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.64 
 
 
386 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.02 
 
 
196 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  39.89 
 
 
199 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.54 
 
 
196 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  39.47 
 
 
197 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.57 
 
 
369 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  37.5 
 
 
191 aa  121  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.04 
 
 
369 aa  121  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.79 
 
 
197 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.25 
 
 
197 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.74 
 
 
398 aa  117  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.25 
 
 
197 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  39.06 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.36 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  38.83 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.97 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.77 
 
 
195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0666  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.22 
 
 
191 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240929  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.97 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  32.79 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  37.27 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.38 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.05 
 
 
202 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.55 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.14 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  32.81 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.81 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.81 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.63 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.54 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.88 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  30.33 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  28.08 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.36 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.15 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.6 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.63 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  29.79 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  33.04 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.46 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  31.15 
 
 
192 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  29.51 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.97 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  28.66 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.63 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  25.56 
 
 
190 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.93 
 
 
217 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.01 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.37 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.07 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.91 
 
 
212 aa  48.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  29.91 
 
 
192 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  30.51 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.77 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.66 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  25.23 
 
 
426 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.33 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.66 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  31.71 
 
 
194 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.4 
 
 
196 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.64 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.33 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.15 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.27 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.03 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  25.23 
 
 
426 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  29.3 
 
 
172 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.78 
 
 
184 aa  45.1  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3875  peroxidase family protein  32.5 
 
 
184 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0496445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  27.66 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.55 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  30.33 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  28.1 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.71 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.66 
 
 
172 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  25.23 
 
 
426 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.11 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.79 
 
 
172 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.37 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.22 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  24.64 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  40.43 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  28.37 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.37 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.37 
 
 
192 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>