124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2744 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  100 
 
 
472 aa  934    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05610  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  71.43 
 
 
197 aa  276  6e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429163  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  65.22 
 
 
200 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.64 
 
 
377 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.39 
 
 
377 aa  220  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4848  hypothetical protein  58 
 
 
202 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.78 
 
 
372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1051  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.3 
 
 
195 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.57 
 
 
371 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.57 
 
 
372 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.17 
 
 
210 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4899  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.5 
 
 
202 aa  180  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  45.31 
 
 
192 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.77 
 
 
386 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  36.88 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.11 
 
 
204 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  43.81 
 
 
208 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.39 
 
 
398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.38 
 
 
196 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.49 
 
 
196 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  45.74 
 
 
183 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  38.5 
 
 
199 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  44.39 
 
 
189 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.23 
 
 
196 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.89 
 
 
197 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  38.14 
 
 
196 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.11 
 
 
195 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.78 
 
 
197 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.36 
 
 
197 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  38.02 
 
 
191 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  38.42 
 
 
197 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  39.04 
 
 
197 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.89 
 
 
196 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  43.3 
 
 
214 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  45.73 
 
 
231 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.36 
 
 
369 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.9 
 
 
369 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.43 
 
 
192 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0666  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.5 
 
 
191 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240929  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.62 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  30.86 
 
 
201 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  28.42 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  34.15 
 
 
195 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  34.21 
 
 
176 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.23 
 
 
202 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  33.06 
 
 
208 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.06 
 
 
208 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.06 
 
 
208 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  30.77 
 
 
191 aa  59.7  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.17 
 
 
214 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.23 
 
 
210 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.95 
 
 
194 aa  58.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.94 
 
 
216 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.77 
 
 
217 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  30.15 
 
 
192 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.06 
 
 
209 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.83 
 
 
228 aa  57  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  30.53 
 
 
178 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  31.22 
 
 
626 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  42.19 
 
 
189 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  22.36 
 
 
426 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  29.57 
 
 
173 aa  53.9  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.01 
 
 
192 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.82 
 
 
212 aa  53.5  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.14 
 
 
192 aa  53.5  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  30.16 
 
 
630 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.41 
 
 
191 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.54 
 
 
192 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  22.36 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.01 
 
 
192 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  27.89 
 
 
173 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  30.56 
 
 
190 aa  51.6  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.52 
 
 
192 aa  51.6  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  27.94 
 
 
192 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  30.15 
 
 
194 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.39 
 
 
200 aa  50.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  30.96 
 
 
182 aa  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  30.37 
 
 
635 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.95 
 
 
196 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  25.58 
 
 
194 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.21 
 
 
192 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  22.36 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.68 
 
 
192 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  26.43 
 
 
201 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  28.5 
 
 
175 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  27.94 
 
 
202 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  26.95 
 
 
192 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.74 
 
 
198 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.03 
 
 
202 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.95 
 
 
192 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3875  peroxidase family protein  33.06 
 
 
184 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0496445 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.15 
 
 
196 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.95 
 
 
192 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.78 
 
 
192 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.74 
 
 
199 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  29.2 
 
 
214 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.18 
 
 
176 aa  47.4  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.74 
 
 
190 aa  47.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  27.66 
 
 
172 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.72 
 
 
172 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>