31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05600 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  352  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.74 
 
 		 472 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  40.1 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  38.83 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  42.47 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  41.49 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  41.2 
 
 		 231 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.36 
 
 		 372 aa  97.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.89 
 
 		 377 aa  92  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.27 
 
 		 372 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.42 
 
 		 377 aa  89  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.76 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  36.9 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  39.39 
 
 		 630 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  39.33 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  39.01 
 
 		 635 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  37.74 
 
 		 176 aa  72  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  38.46 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  32.3 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  38.18 
 
 		 626 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  38 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  38.26 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  35.06 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.52 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  36.05 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.85 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  34.64 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  32.72 
 
 		 175 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  28.66 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  33.54 
 
 		 391 aa  42.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>