39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2815 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  343  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  84.3 
 
 		 175 aa  264  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  51.55 
 
 		 626 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  51.55 
 
 		 630 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  48.48 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  49.7 
 
 		 635 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  42.44 
 
 		 178 aa  120  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  44.91 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.44 
 
 		 398 aa  107  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.72 
 
 		 386 aa  89  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  37.89 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  41.83 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  41.72 
 
 		 176 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  42.21 
 
 		 176 aa  84  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  42.38 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  38.6 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.63 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.67 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  29.53 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  32.3 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.93 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  31.29 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  28.26 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  25.89 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.85 
 
 		 372 aa  63.9  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  30.14 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.38 
 
 		 371 aa  52.4  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.89 
 
 		 472 aa  51.6  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.33 
 
 		 369 aa  51.6  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.69 
 
 		 396 aa  50.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 369 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  42.62 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  27.59 
 
 		 426 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  27.59 
 
 		 426 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  27.59 
 
 		 426 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1400  hypothetical protein  30.28 
 
 		 401 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1840  hypothetical protein  30.28 
 
 		 375 aa  41.2  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000203222 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2359  putative oxidoreductase  29.36 
 
 		 375 aa  41.2  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>