33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2359 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2359  putative oxidoreductase  100 
 
 		 375 aa  775    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01275  hypothetical protein  95.2 
 
 		 375 aa  741    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1924  hypothetical protein  98.13 
 
 		 375 aa  761    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0400808  hitchhiker  0.00000000100313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1521  hypothetical protein  94.67 
 
 		 401 aa  735    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1840  hypothetical protein  95.47 
 
 		 375 aa  739    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000203222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2338  putative oxidoreductase  95.47 
 
 		 375 aa  743    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0109859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1400  hypothetical protein  94.93 
 
 		 401 aa  739    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1492  hypothetical protein  95.47 
 
 		 401 aa  742    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01264  predicted oxidoreductase  95.2 
 
 		 375 aa  741    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2179  putative oxidoreductase  46.58 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.37 
 
 		 396 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  34.36 
 
 		 426 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  38.39 
 
 		 426 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  37.58 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.2 
 
 		 398 aa  93.2  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.67 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.11 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.89 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.98 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.88 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.86 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.78 
 
 		 196 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.46 
 
 		 196 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  19.55 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  30.36 
 
 		 178 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.83 
 
 		 196 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  29.6 
 
 		 635 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  24.22 
 
 		 197 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.81 
 
 		 195 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  27.73 
 
 		 176 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  29.2 
 
 		 626 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  19.35 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  29.2 
 
 		 630 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>