53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1887 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  100 
 
 		 635 aa  1247    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  80.57 
 
 		 630 aa  956    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  80.76 
 
 		 626 aa  959    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0818  palmitoyl-CoA hydrolase  63.07 
 
 		 450 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0202  Palmitoyl-CoA hydrolase  37.5 
 
 		 471 aa  207  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  68.79 
 
 		 176 aa  191  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2277  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  38.32 
 
 		 425 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1189  acyl-CoA thioester hydrolase/bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase  33.95 
 
 		 423 aa  183  6e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.539223  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  59.51 
 
 		 178 aa  177  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  51.81 
 
 		 173 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  49.7 
 
 		 173 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  49.13 
 
 		 175 aa  133  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  53.42 
 
 		 398 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2895  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.49 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0627158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.29 
 
 		 386 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2341  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  30.5 
 
 		 438 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  47.47 
 
 		 182 aa  100  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6149  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  32.54 
 
 		 703 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.828805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2501  dienelactone hydrolase family protein  27.42 
 
 		 282 aa  95.1  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  46.67 
 
 		 176 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  44.26 
 
 		 189 aa  92.8  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  44.3 
 
 		 176 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  44.97 
 
 		 176 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  42.95 
 
 		 176 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  38.82 
 
 		 167 aa  76.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.64 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.42 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.76 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  33.16 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  39.01 
 
 		 183 aa  72  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3151  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  30.25 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  36.18 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  33.08 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  33.08 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  33.08 
 
 		 426 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12080  acyl-CoA thioester hydrolase family protein  26.5 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.66152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2174  hypothetical protein  28.51 
 
 		 311 aa  62  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.5 
 
 		 372 aa  60.1  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.02 
 
 		 377 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.84 
 
 		 396 aa  60.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  31.72 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.18 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09520  acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.82 
 
 		 306 aa  55.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.157478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.15 
 
 		 372 aa  54.3  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  31.9 
 
 		 231 aa  51.6  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  29.65 
 
 		 214 aa  50.8  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.37 
 
 		 472 aa  49.7  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2179  putative oxidoreductase  32.48 
 
 		 333 aa  48.1  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1400  hypothetical protein  28.8 
 
 		 401 aa  45.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  31.29 
 
 		 160 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2359  putative oxidoreductase  29.6 
 
 		 375 aa  44.3  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1840  hypothetical protein  28.8 
 
 		 375 aa  43.9  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000203222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2338  putative oxidoreductase  28.8 
 
 		 375 aa  43.9  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0109859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>