36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0418 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  333  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  58.08 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  52.05 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  51.72 
 
 		 635 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  51.19 
 
 		 630 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  50 
 
 		 626 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  44.51 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  44.77 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.94 
 
 		 398 aa  94.4  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  45.14 
 
 		 189 aa  90.9  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.58 
 
 		 386 aa  87.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  36.27 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  39.24 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  39.6 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  41.25 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  40.67 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  38.36 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  38.78 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.33 
 
 		 369 aa  70.9  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40 
 
 		 369 aa  67.4  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  30.73 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  35.67 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  30.27 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.11 
 
 		 372 aa  62  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.05 
 
 		 377 aa  58.2  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.27 
 
 		 396 aa  57.4  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.48 
 
 		 371 aa  57.4  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.22 
 
 		 377 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.3 
 
 		 372 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.63 
 
 		 472 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  29.08 
 
 		 426 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  29.08 
 
 		 426 aa  52.4  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  29.08 
 
 		 426 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  29.38 
 
 		 214 aa  50.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  28.77 
 
 		 160 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>