37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3852 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  46.05 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  40.99 
 
 		 176 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  38.82 
 
 		 626 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  39.1 
 
 		 173 aa  85.1  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  38.01 
 
 		 183 aa  84.3  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  37.06 
 
 		 630 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  31.61 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  38.82 
 
 		 635 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.38 
 
 		 398 aa  77.8  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  36.81 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.42 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.93 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  30.73 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  33.74 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.49 
 
 		 371 aa  68.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  31.29 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.56 
 
 		 377 aa  67  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  28.8 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.93 
 
 		 377 aa  64.7  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  37.16 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  36.08 
 
 		 182 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.12 
 
 		 386 aa  64.3  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  33.9 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  34.84 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  28.64 
 
 		 231 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.05 
 
 		 372 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  33.55 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  32.68 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.78 
 
 		 369 aa  45.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.11 
 
 		 369 aa  44.3  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 426 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  33.33 
 
 		 426 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 426 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.67 
 
 		 396 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  39.68 
 
 		 391 aa  40.8  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>