51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1765 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  80.57 
 
 		 635 aa  974    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  100 
 
 		 630 aa  1253    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  94.76 
 
 		 626 aa  1141    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0818  palmitoyl-CoA hydrolase  61.99 
 
 		 450 aa  528  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0202  Palmitoyl-CoA hydrolase  39.5 
 
 		 471 aa  229  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1189  acyl-CoA thioester hydrolase/bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.539223  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  69.43 
 
 		 176 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2277  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  38.5 
 
 		 425 aa  189  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  57.06 
 
 		 178 aa  176  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  50.6 
 
 		 173 aa  146  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  51.76 
 
 		 175 aa  146  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  51.55 
 
 		 173 aa  143  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.17 
 
 		 398 aa  118  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2341  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  30.96 
 
 		 438 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2895  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  25.18 
 
 		 458 aa  103  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0627158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.42 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  41.88 
 
 		 189 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6149  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  32.26 
 
 		 703 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.828805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2501  dienelactone hydrolase family protein  28.21 
 
 		 282 aa  96.3  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  44.94 
 
 		 182 aa  90.5  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  42.95 
 
 		 176 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  44.87 
 
 		 176 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  41.29 
 
 		 176 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.67 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.67 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3151  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  30.69 
 
 		 283 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  42.95 
 
 		 176 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  37.06 
 
 		 167 aa  79.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  39.39 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  30.85 
 
 		 192 aa  73.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.15 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.24 
 
 		 371 aa  69.7  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.13 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  31.91 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  31.91 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  31.91 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  32.29 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12080  acyl-CoA thioester hydrolase family protein  25.31 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.66152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.28 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2174  hypothetical protein  28.05 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.51 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.94 
 
 		 372 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  30.98 
 
 		 189 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.16 
 
 		 472 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  27.41 
 
 		 214 aa  52.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  31.66 
 
 		 231 aa  52.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  31.87 
 
 		 160 aa  47.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09520  acyl-CoA thioester hydrolase family protein  25.38 
 
 		 306 aa  47.4  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.157478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2179  putative oxidoreductase  31.62 
 
 		 333 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2516  Esterase/lipase-like protein  37.98 
 
 		 329 aa  44.3  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  27.82 
 
 		 345 aa  43.9  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>