64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1887 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  873    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  98.12 
 
 		 426 aa  855    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  99.06 
 
 		 426 aa  865    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.26 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01264  predicted oxidoreductase  35.7 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01275  hypothetical protein  35.7 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2359  putative oxidoreductase  34.36 
 
 		 375 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1400  hypothetical protein  35.22 
 
 		 401 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1840  hypothetical protein  35.35 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000203222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2338  putative oxidoreductase  34.33 
 
 		 375 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0109859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1492  hypothetical protein  34.33 
 
 		 401 aa  196  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1924  hypothetical protein  34.67 
 
 		 375 aa  196  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0400808  hitchhiker  0.00000000100313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1521  hypothetical protein  34.1 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2179  putative oxidoreductase  32.32 
 
 		 333 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.73 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.21 
 
 		 369 aa  106  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.91 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.54 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.39 
 
 		 377 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.4 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.24 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.51 
 
 		 377 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.78 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  28.73 
 
 		 196 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.73 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.78 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  26.78 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.2 
 
 		 192 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  31.91 
 
 		 626 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  31.91 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  33.08 
 
 		 635 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.47 
 
 		 196 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.92 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  26.92 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  26.49 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  28.97 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  28.33 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.21 
 
 		 197 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  29.37 
 
 		 176 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.35 
 
 		 197 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  25.28 
 
 		 197 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.28 
 
 		 197 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4899  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.45 
 
 		 202 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.5 
 
 		 196 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  24.4 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.17 
 
 		 210 aa  49.7  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  27.59 
 
 		 173 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  27.94 
 
 		 173 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  34.07 
 
 		 160 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05610  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  25.23 
 
 		 197 aa  47.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429163  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  24.29 
 
 		 214 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0666  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 191 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240929  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  28.18 
 
 		 195 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1051  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.93 
 
 		 195 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 201 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.29 
 
 		 214 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.71 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  24.55 
 
 		 201 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4848  hypothetical protein  24.76 
 
 		 202 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  37.33 
 
 		 175 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  38.71 
 
 		 208 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>