122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7169 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1051  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.11 
 
 		 195 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4848  hypothetical protein  60.2 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4899  uncharacterized peroxidase-related enzyme  57.58 
 
 		 202 aa  232  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05610  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  62.5 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.22 
 
 		 472 aa  221  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  57.3 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50 
 
 		 377 aa  175  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  49.47 
 
 		 371 aa  175  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.96 
 
 		 377 aa  167  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.79 
 
 		 372 aa  164  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.35 
 
 		 372 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.85 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  42.42 
 
 		 391 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.22 
 
 		 386 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.3 
 
 		 398 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.64 
 
 		 197 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.34 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.64 
 
 		 197 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.56 
 
 		 369 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.56 
 
 		 369 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.08 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.74 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  40.74 
 
 		 197 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  38.04 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.8 
 
 		 196 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  36.41 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  38.25 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.25 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  36.7 
 
 		 191 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.78 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.91 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0666  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.87 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240929  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  31.28 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.93 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  29.38 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.84 
 
 		 396 aa  61.6  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.45 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.93 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3875  peroxidase family protein  35.9 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0496445 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.26 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.41 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  29.63 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  27.27 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  28.33 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.36 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.63 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  32.46 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  28.33 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.41 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  28.33 
 
 		 426 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.9 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8777  peroxidase family protein  33.33 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  26.85 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.91 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6526  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.13 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00474121  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.83 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  22.86 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.78 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.78 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6383  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  decreased coverage  0.00344136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.44 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  23.78 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.68 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.35 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.93 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  27.78 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.93 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.44 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  26.85 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.36 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.41 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.03 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.85 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.35 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.79 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.39 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.67 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  29.31 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.31 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.31 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.41 
 
 		 192 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  29.91 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  24.29 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.91 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  28.48 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  28.97 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.41 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.17 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9085  hypothetical protein  36.97 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  24.07 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.58 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4078  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.95 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.201946  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.79 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.79 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>