25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1840 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2359  putative oxidoreductase  95.47 
 
 		 375 aa  739    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01275  hypothetical protein  96.53 
 
 		 375 aa  746    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1924  hypothetical protein  96.53 
 
 		 375 aa  745    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0400808  hitchhiker  0.00000000100313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1521  hypothetical protein  96.27 
 
 		 401 aa  743    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1400  hypothetical protein  96.27 
 
 		 401 aa  744    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1492  hypothetical protein  97.07 
 
 		 401 aa  749    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1840  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  774    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000203222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01264  predicted oxidoreductase  96.53 
 
 		 375 aa  746    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2338  putative oxidoreductase  96.8 
 
 		 375 aa  750    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0109859 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2179  putative oxidoreductase  47.63 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.28 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  34.27 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  35.35 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  37.22 
 
 		 426 aa  195  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.62 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.09 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.89 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.59 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.29 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.26 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.19 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  28.8 
 
 		 635 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  19.87 
 
 		 377 aa  43.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  29.2 
 
 		 626 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  27.73 
 
 		 176 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>