52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2088 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  80.76 
 
 		 635 aa  979    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  94.76 
 
 		 630 aa  1140    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  100 
 
 		 626 aa  1239    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0818  palmitoyl-CoA hydrolase  63.47 
 
 		 450 aa  541  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0202  Palmitoyl-CoA hydrolase  39.41 
 
 		 471 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2277  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  39.21 
 
 		 425 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1189  acyl-CoA thioester hydrolase/bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase  34.26 
 
 		 423 aa  196  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.539223  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  68.15 
 
 		 176 aa  190  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  55.88 
 
 		 178 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  51.76 
 
 		 175 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  51.55 
 
 		 173 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  49.4 
 
 		 173 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2895  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.82 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0627158  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  52.17 
 
 		 398 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2341  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  30.88 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.86 
 
 		 386 aa  107  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6149  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  32.12 
 
 		 703 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.828805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2501  dienelactone hydrolase family protein  27.17 
 
 		 282 aa  97.8  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  40.31 
 
 		 189 aa  92  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  44.3 
 
 		 176 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  44.94 
 
 		 182 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  38.82 
 
 		 167 aa  82.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  44.23 
 
 		 176 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  42.68 
 
 		 176 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.67 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3151  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  30.71 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.67 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  41.45 
 
 		 176 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  31.38 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  38.18 
 
 		 183 aa  68.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.14 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  31.91 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  31.91 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  31.91 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.54 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2174  hypothetical protein  29.41 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12080  acyl-CoA thioester hydrolase family protein  25.62 
 
 		 331 aa  63.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.66152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.28 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.9 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.51 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  31.25 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.3 
 
 		 372 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.22 
 
 		 472 aa  55.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09520  acyl-CoA thioester hydrolase family protein  26.32 
 
 		 306 aa  52.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.157478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  30.98 
 
 		 189 aa  51.6  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  28.14 
 
 		 214 aa  51.2  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  30.65 
 
 		 231 aa  48.5  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2179  putative oxidoreductase  31.62 
 
 		 333 aa  47.4  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  28.03 
 
 		 345 aa  47.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.84 
 
 		 197 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.03 
 
 		 197 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1400  hypothetical protein  30.09 
 
 		 401 aa  43.9  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>