34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1052 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  53.05 
 
 
208 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  49.75 
 
 
192 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  47.89 
 
 
214 aa  154  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  49.5 
 
 
189 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.73 
 
 
472 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  41.2 
 
 
183 aa  112  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.48 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.98 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  30.62 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.66 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  33 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.61 
 
 
371 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  39.76 
 
 
160 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  29.72 
 
 
167 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  33.33 
 
 
635 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  31.66 
 
 
630 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.65 
 
 
398 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  30.48 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  50 
 
 
189 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  31.25 
 
 
182 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  30.65 
 
 
626 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  32.34 
 
 
176 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  30.14 
 
 
176 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.71 
 
 
396 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  31.66 
 
 
176 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.22 
 
 
386 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  38.46 
 
 
426 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  48.08 
 
 
176 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  38.46 
 
 
426 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  38.46 
 
 
426 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  43.33 
 
 
178 aa  45.1  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>