30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4900 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  371  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  48.42 
 
 		 192 aa  178  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  50.26 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  46.6 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  49.5 
 
 		 231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.79 
 
 		 472 aa  124  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  42.47 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.27 
 
 		 372 aa  89.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 372 aa  71.2  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  28.26 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  30.81 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  30.81 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.27 
 
 		 371 aa  61.2  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  28.8 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  29.67 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  31.72 
 
 		 635 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.95 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.88 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  30.32 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  30.98 
 
 		 630 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  30.98 
 
 		 626 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  55.32 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  42.62 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  36.62 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  53.19 
 
 		 176 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.82 
 
 		 396 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.72 
 
 		 398 aa  45.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  30.27 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.04 
 
 		 386 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  30.68 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>