44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0667 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  307  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  46.05 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.12 
 
 
372 aa  70.9  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  31.18 
 
 
208 aa  67.4  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.25 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.82 
 
 
371 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  33.76 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.44 
 
 
398 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 
377 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.52 
 
 
372 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  31.21 
 
 
183 aa  57.4  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  39.76 
 
 
231 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  35.09 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  28.39 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  31.87 
 
 
630 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  25.82 
 
 
189 aa  51.6  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  43.75 
 
 
189 aa  50.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  35.29 
 
 
176 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  31.29 
 
 
635 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  50.94 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  36.49 
 
 
426 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  36.49 
 
 
426 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  29.75 
 
 
175 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  36.49 
 
 
426 aa  48.5  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  36.36 
 
 
176 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  27.45 
 
 
173 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.11 
 
 
396 aa  47.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.2 
 
 
472 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  48.08 
 
 
176 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.54 
 
 
386 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  32.14 
 
 
626 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.86 
 
 
369 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.08 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  30.83 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  37.82 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  30.08 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  29.32 
 
 
197 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  29.49 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.08 
 
 
196 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2179  putative oxidoreductase  31.58 
 
 
333 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.28 
 
 
369 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3962  peroxidase-like  27.2 
 
 
191 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.338877 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.82 
 
 
192 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>