45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3580 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  98.1 
 
 		 176 aa  291  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  84.66 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  84.09 
 
 		 176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  78.82 
 
 		 182 aa  207  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  46.24 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  41.92 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  43.4 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  45.34 
 
 		 635 aa  98.2  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  40.34 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  41.14 
 
 		 630 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  42.37 
 
 		 626 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  44.51 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  39.61 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  37.63 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.04 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  37.97 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.47 
 
 		 386 aa  64.3  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.81 
 
 		 377 aa  61.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  32.43 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  29.63 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  32.73 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.1 
 
 		 372 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.12 
 
 		 377 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  33.79 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.27 
 
 		 369 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.14 
 
 		 372 aa  52  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  48.33 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.93 
 
 		 369 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.34 
 
 		 396 aa  48.5  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  46.67 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.32 
 
 		 371 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2359  putative oxidoreductase  30.91 
 
 		 375 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2179  putative oxidoreductase  32.17 
 
 		 333 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  33.63 
 
 		 426 aa  42  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  33.63 
 
 		 426 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1400  hypothetical protein  28.47 
 
 		 401 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1924  hypothetical protein  30 
 
 		 375 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0400808  hitchhiker  0.00000000100313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  33.63 
 
 		 426 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01264  predicted oxidoreductase  28.47 
 
 		 375 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01275  hypothetical protein  28.47 
 
 		 375 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.43 
 
 		 472 aa  41.6  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2338  putative oxidoreductase  28.47 
 
 		 375 aa  41.6  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0109859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1492  hypothetical protein  28.47 
 
 		 401 aa  41.2  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1840  hypothetical protein  28.47 
 
 		 375 aa  41.2  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000203222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>