24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01275 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1400  hypothetical protein  99.47 
 
 
401 aa  771    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205416  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1521  hypothetical protein  97.33 
 
 
401 aa  754    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1840  hypothetical protein  96.53 
 
 
375 aa  746    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000203222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2338  putative oxidoreductase  97.87 
 
 
375 aa  761    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0109859 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1924  hypothetical protein  96 
 
 
375 aa  745    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0400808  hitchhiker  0.00000000100313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1492  hypothetical protein  98.13 
 
 
401 aa  760    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277519  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01275  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  774    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01264  predicted oxidoreductase  100 
 
 
375 aa  774    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2359  putative oxidoreductase  95.2 
 
 
375 aa  741    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2179  putative oxidoreductase  46.72 
 
 
333 aa  315  8e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.99 
 
 
396 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  35.7 
 
 
426 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  38.07 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  35.29 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.33 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.8 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.07 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.99 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.37 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.46 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.1 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  28.8 
 
 
635 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  30.36 
 
 
178 aa  43.1  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  27.73 
 
 
176 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>