63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2546 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  99.06 
 
 
426 aa  864    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  98.12 
 
 
426 aa  855    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  871    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.03 
 
 
396 aa  279  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01275  hypothetical protein  35.29 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01264  predicted oxidoreductase  35.29 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1400  hypothetical protein  34.82 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1840  hypothetical protein  34.27 
 
 
375 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000203222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2338  putative oxidoreductase  33.64 
 
 
375 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0109859 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2359  putative oxidoreductase  38.39 
 
 
375 aa  196  9e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1492  hypothetical protein  33.64 
 
 
401 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1924  hypothetical protein  36.94 
 
 
375 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0400808  hitchhiker  0.00000000100313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1521  hypothetical protein  33.56 
 
 
401 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2179  putative oxidoreductase  42.68 
 
 
333 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.27 
 
 
398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.21 
 
 
369 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.91 
 
 
369 aa  103  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.75 
 
 
386 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.67 
 
 
372 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.95 
 
 
371 aa  93.6  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.1 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.24 
 
 
372 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.22 
 
 
377 aa  87  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.78 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.05 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.73 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  28.73 
 
 
196 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  31.91 
 
 
626 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.78 
 
 
196 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  31.91 
 
 
630 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  25.41 
 
 
199 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  33.08 
 
 
635 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  26.52 
 
 
191 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.67 
 
 
196 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.11 
 
 
196 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  26.11 
 
 
197 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  29.37 
 
 
178 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  29.37 
 
 
176 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  28.33 
 
 
200 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.72 
 
 
197 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  24.16 
 
 
197 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.72 
 
 
197 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.16 
 
 
197 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4899  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.45 
 
 
202 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.5 
 
 
196 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  27.59 
 
 
173 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.13 
 
 
210 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  27.94 
 
 
173 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  24.4 
 
 
391 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  34.07 
 
 
160 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  29.09 
 
 
195 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0666  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.89 
 
 
191 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240929  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  24.26 
 
 
214 aa  46.6  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.29 
 
 
214 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  40 
 
 
189 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 
201 aa  44.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05610  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  25.23 
 
 
197 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  37.33 
 
 
175 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  38.71 
 
 
208 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  24.55 
 
 
201 aa  43.5  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1051  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.93 
 
 
195 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  32.22 
 
 
214 aa  43.1  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.451279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>