35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4849 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  50.79 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  51.24 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  53.05 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  50.26 
 
 		 189 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.81 
 
 		 472 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  41.49 
 
 		 183 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  36.32 
 
 		 176 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  35.11 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  36.6 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  34.01 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  35.56 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.99 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  29.53 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  31.61 
 
 		 167 aa  72  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  37.08 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  32.47 
 
 		 175 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.04 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  36.16 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  33.89 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.27 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.52 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  36.18 
 
 		 635 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  35.79 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  32.29 
 
 		 630 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.18 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.16 
 
 		 377 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  31.22 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.21 
 
 		 386 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48 
 
 		 396 aa  58.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  31.25 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  38.71 
 
 		 426 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  38.71 
 
 		 426 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  38.71 
 
 		 426 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3962  peroxidase-like  33.87 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.338877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>