35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5314 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  333  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  90.91 
 
 		 176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  82.91 
 
 		 176 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  84.09 
 
 		 176 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  80 
 
 		 182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  46.24 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  44.03 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  41.32 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  42.77 
 
 		 630 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  40.8 
 
 		 175 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  43.9 
 
 		 635 aa  94.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  42.61 
 
 		 626 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  37.11 
 
 		 208 aa  87.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  42.86 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  39.74 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  40.13 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.04 
 
 		 398 aa  74.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.95 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  36.08 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  32.43 
 
 		 214 aa  62  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.9 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  32.62 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.28 
 
 		 369 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  30.16 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.28 
 
 		 369 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.12 
 
 		 372 aa  54.3  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.21 
 
 		 372 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.46 
 
 		 472 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  30.49 
 
 		 231 aa  52  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  37.66 
 
 		 160 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.48 
 
 		 396 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.67 
 
 		 371 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3962  peroxidase-like  28.82 
 
 		 191 aa  44.3  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.338877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2179  putative oxidoreductase  32.17 
 
 		 333 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>