21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1521 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2359  putative oxidoreductase  94.67 
 
 
375 aa  735    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01275  hypothetical protein  97.33 
 
 
375 aa  754    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1400  hypothetical protein  97.26 
 
 
401 aa  807    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1492  hypothetical protein  99.25 
 
 
401 aa  820    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1924  hypothetical protein  96.53 
 
 
375 aa  748    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0400808  hitchhiker  0.00000000100313 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01264  predicted oxidoreductase  97.33 
 
 
375 aa  754    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2338  putative oxidoreductase  98.67 
 
 
375 aa  763    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0109859 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1840  hypothetical protein  96.27 
 
 
375 aa  743    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000203222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1521  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  826    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2179  putative oxidoreductase  46.46 
 
 
333 aa  308  8e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.99 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  34.1 
 
 
426 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  33.56 
 
 
426 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  36.19 
 
 
426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.16 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.64 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.6 
 
 
369 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.38 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.49 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.01 
 
 
372 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.66 
 
 
371 aa  49.7  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>