66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1745 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1745  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  367  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1701  hypothetical protein  52.54 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0984593  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0485  hypothetical protein  45.76 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3037  hypothetical protein  33.55 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0597089 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1024  hypothetical protein  31.4 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.81 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.07 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.86 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.28 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.06 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.94 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.92 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  22.1 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  26.42 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.45 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.53 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  27.67 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  22.28 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  21.74 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  30.46 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  29.41 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.33 
 
 		 184 aa  47.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.16 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.16 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.56 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.84 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.39 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  24.42 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  23.53 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  23.98 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.03 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  20.9 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.12 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  23.56 
 
 		 189 aa  44.3  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  21.97 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  20.34 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.12 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  20.9 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.48 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  22.16 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  23.84 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  32 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.16 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.08 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  26.42 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.65 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.98 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  22.93 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.26 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.48 
 
 		 193 aa  42  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.73 
 
 		 214 aa  41.6  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.32 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  31.68 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.71 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  22.53 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  26.14 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  20.93 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.97 
 
 		 192 aa  40.8  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  23.6 
 
 		 183 aa  41.2  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1021  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.6 
 
 		 210 aa  40.8  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>