47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0485 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0485  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1745  hypothetical protein  45.76 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1701  hypothetical protein  46.33 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0984593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.94 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.55 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1024  hypothetical protein  31.98 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3037  hypothetical protein  28.07 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0597089 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  27.68 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.59 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.94 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.68 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.85 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  27.59 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  30.41 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  27.56 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.52 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.42 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.86 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  26.25 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1021  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.84 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.81 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  26.24 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  22.45 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.73 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  28.08 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.16 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  27.04 
 
 		 183 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.52 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  24.03 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  24.69 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  25.16 
 
 		 202 aa  44.3  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  21.84 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  21.05 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  20.28 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2532  uncharacterized peroxidase-related enzyme  20.93 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.872008  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  30.84 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  22.22 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  20.59 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  28.26 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  24.09 
 
 		 179 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.09 
 
 		 179 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  24.09 
 
 		 179 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  20.47 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  23.87 
 
 		 175 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  23.08 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.57 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  24.32 
 
 		 202 aa  41.2  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>