289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1655 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1655  major facilitator transporter  100 
 
 		 425 aa  820    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000237125  hitchhiker  0.00412211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 467 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 470 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.22 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 450 aa  96.3  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 457 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 472 aa  93.2  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 443 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 441 aa  86.7  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  27.6 
 
 		 457 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 490 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  27.6 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  25.74 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  27.76 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  22.3 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  26.92 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  26.92 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  28.03 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  30.05 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 578 aa  63.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  31.3 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  31.11 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  30.19 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  24.87 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  25.77 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  26.87 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  24.74 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  25.6 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3153  ABC transporter related  27.72 
 
 		 803 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 530 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  29.21 
 
 		 465 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3191  ABC transporter related  26.72 
 
 		 748 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 536 aa  57  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  29.02 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>