238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1762 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  100 
 
 		 181 aa  356  9e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  68.33 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  49.71 
 
 		 182 aa  167  9e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  49.13 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  48.55 
 
 		 182 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  46.82 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  43.16 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  40.83 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  42.2 
 
 		 178 aa  144  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  40.48 
 
 		 176 aa  141  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  39.88 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  41.46 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  49.24 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  36.63 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  39.41 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  36.36 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  36.99 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  42.41 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  37.87 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  45.03 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  42.69 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  43.27 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  34.5 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  32.74 
 
 		 178 aa  121  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  40 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  43.27 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  29.48 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  33.9 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  35.96 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  33.84 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.45 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  32.22 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  31.22 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  27.27 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  27.27 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  27.27 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  29.14 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  26.7 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  27.27 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  27.27 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  27.81 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  27.7 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  25.17 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  29.33 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  29.22 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  31.17 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  30.41 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  30.63 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  30.63 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  29.41 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  27.33 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  23.16 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  26.8 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  25.83 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  29.14 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  26.29 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0775  ribosomal protein L6  29.81 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  24 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  24.43 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  30.46 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  27.81 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  25.71 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_431  ribosomal protein L6P/L9E  30.13 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000303556  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  29.14 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  26.32 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  26.29 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  30.57 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  27.15 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  28.77 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  27.5 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  23.86 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_002936  DET0489  50S ribosomal protein L6  29.49 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000497907  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  31.45 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  28.48 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  32.58 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  28.1 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  23.53 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  27.38 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  24.57 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  34.83 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  31.82 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  25.33 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  25.64 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  29.22 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  33.71 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  27.45 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  26.4 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  30.72 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  25.17 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  22.88 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0974  50S ribosomal protein L6  26.8 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234587  hitchhiker  0.00000109608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  27.81 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  25 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  25.33 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  24.56 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  25.33 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  32.58 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  28 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  30.3 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  26.92 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>