269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85470 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  66.84 
 
 		 192 aa  244  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  52.33 
 
 		 191 aa  195  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  50 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  50 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  41.81 
 
 		 176 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  40.11 
 
 		 174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  34.83 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  36.36 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  34.86 
 
 		 178 aa  117  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  37.17 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  37.5 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  37.85 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  38.98 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  35.96 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  39.43 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  35.43 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  40 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  38.86 
 
 		 179 aa  114  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  34.86 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  38.86 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  35.23 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  36.16 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  36 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  36.75 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  36.61 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  36.32 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  34.09 
 
 		 177 aa  96.3  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  37.97 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  34.95 
 
 		 196 aa  94.7  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  32.82 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  33.33 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  31.79 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  33.55 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  32.9 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  30.07 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  30.54 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  30.54 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  28.48 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  28.21 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  30.57 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  29.03 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  30.97 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  31.71 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  28.48 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  27.16 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  28.76 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  27.67 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  27.74 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  33.73 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1839  50S ribosomal protein L6  29.49 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  34.09 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  30.13 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0352  50S ribosomal protein L6  29.49 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  24.36 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  27.1 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  27.88 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  26.9 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  27.54 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  26.9 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  30.92 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  27.1 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  25.81 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  28.1 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  32.08 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  29.03 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  26.86 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  27.85 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  27.85 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  27.85 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  27.85 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  27.5 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  27.85 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  30.38 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  28.48 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  27.85 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  27.85 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  29.11 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  25.81 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  27.85 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  30.72 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  25.73 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  27.74 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  26.11 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  26.97 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1851  ribosomal protein L6  27.22 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.56126e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  30.57 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  27.1 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  26.49 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  27.56 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  25.16 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  29.24 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  28.29 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  29.22 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  30.57 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  29.11 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  28.66 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>