More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0163 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  97.25 
 
 		 182 aa  361  4e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  96.7 
 
 		 182 aa  357  6e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  82.97 
 
 		 182 aa  307  5e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  71.04 
 
 		 183 aa  241  6e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  49.44 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  55.23 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  52.1 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  51.46 
 
 		 179 aa  174  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  49.71 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  49.41 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  48.82 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  46.2 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  49.13 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  46.47 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  47.02 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  47.95 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  41.07 
 
 		 174 aa  150  8e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  40 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  41.76 
 
 		 178 aa  148  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  47.37 
 
 		 181 aa  140  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  43.59 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  37.43 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  39.01 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  35.75 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  39.34 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  40 
 
 		 191 aa  114  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  38.25 
 
 		 196 aa  114  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  39.26 
 
 		 195 aa  114  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  37.29 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  38.46 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  37.78 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.22 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  34.67 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  34.09 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  32.43 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  32.77 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  33.78 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  33.9 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  33.71 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  33.99 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  29.05 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  36 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  32.21 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  33.56 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  34.27 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  30.81 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_431  ribosomal protein L6P/L9E  36 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000303556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  34.9 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0099  50S ribosomal protein L6  27.27 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.492804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  28.28 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  31.76 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  31.76 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  34.19 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  32.43 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  29.78 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  30.51 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  28.38 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0466  50S ribosomal protein L6  35.33 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  33.56 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  30.73 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0294  50S ribosomal protein L6P  30.65 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000550047  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  31.03 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1839  50S ribosomal protein L6  29.03 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0352  50S ribosomal protein L6  29.03 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  33.71 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  27.75 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  32.77 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  29.05 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  28.32 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  31.07 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0335  50S ribosomal protein L6  29.65 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000240759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  32.04 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  30.87 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3509  ribosomal protein L6  33.11 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000396017  hitchhiker  0.00000010719 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  35.06 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  27.75 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  32.3 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  32.3 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  27.12 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  31.03 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  29.38 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  31.08 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  31.43 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  34.48 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  30 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  29.33 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  31.46 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  28.49 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  29.33 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0489  50S ribosomal protein L6  34 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000497907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  32.02 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  30.17 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  31.64 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  31.43 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  33.14 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  33.14 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  32.77 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  29.78 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  32.39 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>