More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1505 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  100 
 
 		 178 aa  360  4e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  49.44 
 
 		 182 aa  192  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  49.44 
 
 		 182 aa  191  5e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  49.44 
 
 		 182 aa  191  6e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  50.56 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  50.29 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  47.37 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  48.8 
 
 		 174 aa  175  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  46.2 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  47.65 
 
 		 176 aa  170  9e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  46.43 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  51.27 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  46.51 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  44.12 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  45.03 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  41.32 
 
 		 178 aa  157  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  39.29 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  39.88 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  38.82 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  42.2 
 
 		 181 aa  144  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  39.18 
 
 		 185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  41.21 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  43.23 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  42.11 
 
 		 181 aa  128  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  43.67 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  39.33 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  38.25 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  39.01 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  35.23 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  29.9 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  30.51 
 
 		 191 aa  97.8  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.51 
 
 		 191 aa  94.4  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  30.56 
 
 		 192 aa  84.3  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  34.38 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  31.21 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  34.18 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  32.28 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  31.37 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  38 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  35.76 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  32.26 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  32.28 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  31.71 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  32.08 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  32.28 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  38.31 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  37.27 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  31.37 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  31.48 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  32 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  32.41 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  34.16 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  33.96 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  33.96 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  33.96 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  33.96 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  33.96 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  41.76 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  33.96 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  33.96 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  33.96 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  33.79 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  35.06 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0775  ribosomal protein L6  31.36 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  33.54 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  26.83 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  31.37 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  31.36 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  33.54 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  31.36 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  30.97 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  32.93 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  33.54 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  40.22 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  29.27 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  29.94 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  30.38 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  31.17 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  36 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  31.17 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  38.89 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  30.72 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  31.21 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  29.87 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0338  50S ribosomal protein L6  32.69 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000132809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  29.56 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  33.76 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3509  ribosomal protein L6  35.85 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000396017  hitchhiker  0.00000010719 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  31.37 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  29.56 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  29.11 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  29.11 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  29.49 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  29.49 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  31.08 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  31.01 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  31.21 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>