295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1844 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  78.09 
 
 		 178 aa  286  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  73.86 
 
 		 177 aa  271  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  73.14 
 
 		 177 aa  258  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  71.18 
 
 		 179 aa  251  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  49.1 
 
 		 176 aa  175  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  48.24 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  44.91 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  41.32 
 
 		 178 aa  157  9e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  44.12 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  44.87 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  41.24 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  40 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  41.76 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  41.76 
 
 		 182 aa  149  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  43.03 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  41.76 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  40 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  38.95 
 
 		 176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  32.74 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  36.36 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  36.26 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  39.62 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  34.86 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  36.36 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  36.57 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  34.84 
 
 		 191 aa  105  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  33.33 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  36.57 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.4 
 
 		 191 aa  98.2  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  34.29 
 
 		 196 aa  95.5  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  35.11 
 
 		 196 aa  94.7  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  32.85 
 
 		 196 aa  92  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  30 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  33.83 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  29.14 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  30.87 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  29.32 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  28.29 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  29.53 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  33.57 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  26.17 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  28.57 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0775  ribosomal protein L6  29.41 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0466  50S ribosomal protein L6  27.68 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_431  ribosomal protein L6P/L9E  27.12 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000303556  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  28.19 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  27.81 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  29.93 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  28.03 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  33.08 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  30.22 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  30.2 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  31.16 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  30.77 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1953  ribosomal protein L6  29.92 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  30.41 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  27.15 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  29.25 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  26.53 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0489  50S ribosomal protein L6  26.55 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000497907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  30.14 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  27.56 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  24.66 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  25.64 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  26.03 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  29.73 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  24.67 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  32.35 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  27.81 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  24 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  27.45 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  24.83 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  23.53 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  28.48 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  27.92 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  26.97 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  27.45 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  27.33 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  28.97 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  28.77 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  28.08 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  27.03 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  27.27 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  26.9 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  26.85 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  26 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  27.03 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  28.79 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  26.32 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  25.85 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  29.41 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0049  50S ribosomal protein L6  24.29 
 
 		 178 aa  51.2  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560841  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  25.33 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  22.82 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  28.24 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  27.19 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  23.38 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  28.03 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  25 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>