269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2234 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  100 
 
 
177 aa  356  9e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  89.94 
 
 
179 aa  325  2.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  73.86 
 
 
178 aa  272  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  75 
 
 
177 aa  266  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  73.14 
 
 
178 aa  258  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  49.1 
 
 
177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  48.82 
 
 
177 aa  175  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  47.62 
 
 
176 aa  171  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  46.2 
 
 
182 aa  167  8e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  50.31 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  47.95 
 
 
182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  47.37 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  47.95 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  43.45 
 
 
174 aa  155  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  41.07 
 
 
174 aa  155  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  39.88 
 
 
178 aa  153  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  41.57 
 
 
176 aa  152  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  43.71 
 
 
174 aa  150  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  41.92 
 
 
176 aa  147  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  36.63 
 
 
181 aa  137  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  42.13 
 
 
192 aa  123  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  38.01 
 
 
185 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  38.98 
 
 
191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  39.87 
 
 
195 aa  114  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  38.04 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  34.88 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  38.1 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  36.48 
 
 
196 aa  108  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  35.85 
 
 
196 aa  106  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  35.4 
 
 
196 aa  100  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  36.57 
 
 
191 aa  99.4  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  33.96 
 
 
196 aa  97.4  9e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.15 
 
 
191 aa  95.1  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0466  50S ribosomal protein L6  32.04 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_431  ribosomal protein L6P/L9E  30.68 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000303556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  28.67 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  29.8 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0489  50S ribosomal protein L6  28.41 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000497907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  29.05 
 
 
178 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  26.85 
 
 
179 aa  61.6  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  29.61 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  28.38 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  29.14 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  28.86 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  28 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 
176 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  31.03 
 
 
179 aa  57.8  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  26.67 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  30.41 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  30 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  26.67 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  25 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  27.52 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  26.97 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  30.14 
 
 
179 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  25.5 
 
 
181 aa  54.3  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  27.45 
 
 
180 aa  54.3  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  30.14 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  30.14 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  30.14 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  30.14 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  30.14 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  27.89 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  30.14 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  27.89 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  30.14 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  27.7 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  28.19 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  30.14 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  28.48 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  32.45 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  36.84 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  26 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  29.14 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  28.85 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  29.93 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  28.47 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  27.45 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  26.58 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  29.05 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  30.23 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  28.86 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  26.53 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  28.21 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  27.21 
 
 
176 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  28.47 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  28.21 
 
 
179 aa  52  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  29.01 
 
 
185 aa  52  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  26.8 
 
 
178 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  28.95 
 
 
179 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  23.87 
 
 
179 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  29.33 
 
 
179 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  26 
 
 
179 aa  51.6  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  28.76 
 
 
178 aa  51.6  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  26.85 
 
 
182 aa  51.6  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  26.9 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>