More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0458 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 176 aa  360  4e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  65.32 
 
 		 174 aa  238  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  59.88 
 
 		 174 aa  218  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  56.82 
 
 		 176 aa  214  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  53.18 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  52.38 
 
 		 174 aa  185  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  47.95 
 
 		 176 aa  175  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  47.65 
 
 		 178 aa  170  9e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  49.13 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  45.88 
 
 		 182 aa  167  8e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  46.47 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  46.47 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  46.47 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  52.05 
 
 		 183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  43.35 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  41.57 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  41.42 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  38.95 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  38.69 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  36.99 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  39.38 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  39.13 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  36.31 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  37.57 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  36.36 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.67 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  37.14 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  35.52 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  35.43 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  35.52 
 
 		 196 aa  104  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  35.52 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  34.97 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  34.78 
 
 		 196 aa  99.4  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  35.19 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  34.1 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  32.21 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  38.41 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  34.36 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  31.85 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  34.69 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  32.53 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  33.74 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  34.55 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  33.12 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0775  ribosomal protein L6  30.06 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  31.21 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  34.67 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  33.54 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  33.96 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  34.25 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  33.73 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  34.69 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  32.68 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  34.01 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  33.77 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  34.01 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  34.01 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  33.54 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  33.12 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  34.01 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  32.67 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  31.11 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  30.64 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  31.11 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  32.3 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  35.44 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  32.52 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  36.05 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  36.05 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  31.21 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  29.78 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  32 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  32.67 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  32.91 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  35.37 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  35.44 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  30.54 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  35.44 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  34.67 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  30.87 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  32.28 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  30.43 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  32.67 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  34.01 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  32.95 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  34.18 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  34 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  31.33 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  30.64 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  32.69 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  30.3 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  34.38 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  31.06 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>