More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0608 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  53.44 
 
 		 195 aa  188  5e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  46.19 
 
 		 196 aa  174  7e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  48.22 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  47.72 
 
 		 196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  44.67 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  43.16 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  39.47 
 
 		 181 aa  130  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  37.82 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  43.23 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  42.38 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  52.5 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  36.31 
 
 		 176 aa  125  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  41.67 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  43.51 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  44.16 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  44.23 
 
 		 182 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  43.59 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  42.95 
 
 		 182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.08 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  42.95 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  37.17 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  36.36 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  40.79 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  35.42 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  38.04 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  32.35 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  39.47 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  36.84 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  41.83 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  34.87 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  38.31 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  34.84 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  37.33 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  31.52 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  31.79 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  29.7 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  31.76 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  33.56 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  35.17 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  30.2 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  27.21 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  30.87 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  30.77 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  31.68 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  33.1 
 
 		 178 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  30.2 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  30.82 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  29.35 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  34.93 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  28.57 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  29.93 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  33.11 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  31.37 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  30.2 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  31.29 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  26.95 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  28.57 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  28.57 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  30 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  37.21 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  37.21 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  31.13 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  32.65 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  30.81 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  27.21 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  28.83 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  40.7 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  30.25 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0334  50S ribosomal protein L6  32.21 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000427572  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  29.09 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  30.67 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  25.83 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  31.29 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  30.2 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0466  50S ribosomal protein L6  29.53 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  29.09 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  29.73 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  31.29 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  29.25 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  26.06 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  28.57 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  33.56 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  31.97 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1037  50S ribosomal protein L6  28.1 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000958163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  32.21 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  31.97 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  26.49 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  29.25 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  27.33 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  32.14 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  27.81 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0215  50S ribosomal protein L6  27.27 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  hitchhiker  0.000114271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4041  50S ribosomal protein L6  27.27 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000805939  unclonable  0.00000000000307302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4155  50S ribosomal protein L6  27.27 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000600192  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1851  ribosomal protein L6  30.11 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.56126e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>