More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1712 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  100 
 
 
176 aa  351  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 
177 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  52.05 
 
 
174 aa  193  9e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  48.3 
 
 
177 aa  184  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  51.46 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 
174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  51.5 
 
 
182 aa  180  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  52.1 
 
 
182 aa  180  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  52.1 
 
 
182 aa  179  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  47.37 
 
 
178 aa  179  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  50 
 
 
179 aa  179  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  50.9 
 
 
182 aa  177  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  49.1 
 
 
178 aa  175  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  52.87 
 
 
183 aa  176  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  47.95 
 
 
176 aa  175  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  48.21 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  45.51 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  47.62 
 
 
177 aa  171  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  46.71 
 
 
174 aa  169  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.609574 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  40.48 
 
 
181 aa  141  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  41.81 
 
 
191 aa  134  8e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  42.38 
 
 
191 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  43.45 
 
 
181 aa  127  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  40.31 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  42.95 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  38.2 
 
 
191 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  34.29 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  39.75 
 
 
196 aa  114  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  38.33 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  37.27 
 
 
196 aa  108  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  35.4 
 
 
196 aa  105  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  35.4 
 
 
196 aa  104  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.59 
 
 
191 aa  101  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  34.01 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  33.72 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  35.37 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  36.55 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  34.69 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  36.36 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  32.65 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  34.69 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  32.17 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  35.14 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  35.86 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  38.36 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  32.89 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  37.67 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  37.67 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  37.67 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  37.67 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  37.67 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  32.65 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  37.67 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  37.67 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  30.91 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  37.67 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0441  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296356  hitchhiker  0.000109216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  37.67 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  32.41 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  32.67 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  32.41 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  32.41 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  34.27 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  28.57 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  35.86 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0775  ribosomal protein L6  29.19 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  32.52 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  35.33 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  35.33 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  30.61 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  32.17 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  32.17 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  34.48 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  31.97 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  34.48 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  32.41 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  34.48 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  34.48 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  30.2 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  33.77 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  32.19 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  34.25 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  31.97 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  33.57 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  32.65 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  36 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  34.25 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  29.93 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  34.97 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  33.79 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  31.97 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0499  50S ribosomal protein L6  30.26 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000112242  normal  0.0683389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  31.72 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  30.61 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  35.17 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  31.79 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  33.56 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  32.88 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>