More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1837 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  58.55 
 
 		 196 aa  225  3e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  59.07 
 
 		 196 aa  224  4e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  56.7 
 
 		 196 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  54.64 
 
 		 196 aa  214  5e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  53.44 
 
 		 191 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  42.41 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  41.49 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  42.95 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  39.13 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  39.33 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  41.14 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  42.41 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  36.81 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  42.24 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  40.49 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  39.87 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  39.26 
 
 		 182 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  37.99 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  39.88 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  39.62 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  37.78 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  34.76 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  38.27 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  35.33 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  37.67 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.87 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  34.27 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  35.03 
 
 		 177 aa  99  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  37.97 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  34.16 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  35.29 
 
 		 191 aa  92.4  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  33.5 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  36.05 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  32.52 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf426  50S ribosomal protein L6  31.18 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  33.54 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  34.15 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  33.54 
 
 		 177 aa  72  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  33.54 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  32.93 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  31.1 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  34.76 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  30.54 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  31.71 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2824  50S ribosomal protein L6  32.7 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0379678  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  30.49 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  32.7 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  32.93 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  34.13 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0329  50S ribosomal protein L6  31.45 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00323508  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  30.12 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  30.87 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  31.52 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  27.44 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  29.89 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  35.03 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  35.03 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3629  50S ribosomal protein L6  32.08 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000298442  hitchhiker  0.0000000000176204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  31.71 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  29.88 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1939  50S ribosomal protein L6  32.08 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0207492  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2617  50S ribosomal protein L6  32.08 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00663642  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  30.49 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3761  50S ribosomal protein L6  32.08 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0024508  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  30.32 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3731  50S ribosomal protein L6  32.08 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000218121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3789  50S ribosomal protein L6  32.08 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3493  50S ribosomal protein L6  32.08 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0264  50S ribosomal protein L6  33.1 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000279479  hitchhiker  0.0041278 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  32.21 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  36.67 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3154  50S ribosomal protein L6  32.08 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0206863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3462  50S ribosomal protein L6  31.87 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000287307  decreased coverage  0.00473222 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  30.91 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2744  50S ribosomal protein L6  31.87 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000130297  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0282  50S ribosomal protein L6  31.87 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00574931  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0363  50S ribosomal protein L6  31.87 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000934657  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0291  50S ribosomal protein L6  31.87 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000875703  normal  0.0218003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0342  50S ribosomal protein L6  31.87 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157965  normal  0.0125773 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  30.91 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  31.36 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  32.73 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1851  ribosomal protein L6  34.36 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.56126e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  33.78 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  31.08 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  30.3 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  30.3 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  31.54 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0335  50S ribosomal protein L6  28.12 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000198862  hitchhiker  0.000458858 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  32.43 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  35 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  32.77 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  33.33 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  31.54 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  30.65 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>