More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0608 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  85.71 
 
 		 196 aa  352  2e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  82.65 
 
 		 196 aa  340  1e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  80.61 
 
 		 196 aa  329  1e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  59.07 
 
 		 195 aa  224  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  47.72 
 
 		 191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  43.27 
 
 		 181 aa  123  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  39.01 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  39.89 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  39.34 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  39.34 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  41.62 
 
 		 183 aa  115  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  35.85 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  38.46 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  35.91 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  36.48 
 
 		 177 aa  108  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  35.4 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  34.25 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  41.28 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  37.16 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  34.87 
 
 		 177 aa  101  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  34.78 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  34.29 
 
 		 177 aa  98.6  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  34.39 
 
 		 174 aa  98.2  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  29.56 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  32.92 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  35.11 
 
 		 178 aa  94.7  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  34.68 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  31.79 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  38.16 
 
 		 180 aa  88.6  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  33.33 
 
 		 176 aa  87.8  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  30.9 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.02 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  34.86 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  31.76 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  33.56 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  35.44 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  35.44 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf426  50S ribosomal protein L6  29.59 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  28.57 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0264  50S ribosomal protein L6  33.55 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000279479  hitchhiker  0.0041278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  28.95 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0335  50S ribosomal protein L6  28.4 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000198862  hitchhiker  0.000458858 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0291  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000875703  normal  0.0218003 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3493  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2617  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00663642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1939  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0207492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3761  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0024508  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3731  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000218121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2744  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000130297  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0282  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00574931  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0363  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000934657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3154  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0206863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0342  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157965  normal  0.0125773 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3789  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  31.87 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  31.41 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3462  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000287307  decreased coverage  0.00473222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  29.68 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  31.95 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  32.59 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2824  50S ribosomal protein L6  31.58 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0379678  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  30.49 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  30.26 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3629  50S ribosomal protein L6  31.58 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000298442  hitchhiker  0.0000000000176204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  31.79 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  31.36 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  28.79 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0329  50S ribosomal protein L6  30.26 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00323508  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  31.41 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  31.41 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  26.04 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  30 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  30.67 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  34.16 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  31.61 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  30.77 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  29.41 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  30.18 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  30.72 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  30 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  30.18 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  26.63 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  33.14 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  32.48 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  28.82 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  27.81 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3934  50S ribosomal protein L6  27.81 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  30 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>