More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0017 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 177 aa  357  4e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  68.18 
 
 		 177 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  50 
 
 		 176 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  52.05 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  53.22 
 
 		 176 aa  189  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  53.18 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  50.9 
 
 		 174 aa  185  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  50.29 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  49.1 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  48.21 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  49.1 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  49.71 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  49.71 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  49.14 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  49.1 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  50.57 
 
 		 182 aa  169  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  44.91 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  55.32 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  43.11 
 
 		 178 aa  164  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  44.97 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  39.41 
 
 		 181 aa  137  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  38.82 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  40.79 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.25 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  36.16 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  35.64 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  34.29 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  34.46 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  35.03 
 
 		 195 aa  99  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  33.14 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  34.29 
 
 		 196 aa  98.6  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  34.44 
 
 		 196 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  33.7 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  37.42 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  36.65 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  36.65 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  34.76 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  38.16 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  35.48 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  36.13 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  30.97 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  33.12 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  33.12 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  32.73 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  33.99 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  31.48 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  33.76 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  35.06 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  35.06 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  35.15 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  30.77 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  32.47 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  35.9 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1722  50S ribosomal protein L6  31.84 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0239785  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  32.69 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  35.26 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  33.55 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  31.41 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  31.41 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  32.68 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_431  ribosomal protein L6P/L9E  31.82 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000303556  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  29.93 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  30.13 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0509  50S ribosomal protein L6  33.54 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.910827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  29.49 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  32.45 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0466  50S ribosomal protein L6  33.12 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  33.96 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  29.27 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  32.9 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  30.32 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  30.72 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  30.07 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  30.32 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  30.52 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  31.68 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  30.07 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  30.07 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  30.07 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  31.17 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  30.07 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  26.38 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  31.21 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  28.57 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  30.67 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  29.88 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  30.38 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  28.76 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  31.61 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>