More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2433 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 177 aa  357  6e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  73.86 
 
 		 178 aa  271  4.0000000000000004e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  75 
 
 		 177 aa  266  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  73.03 
 
 		 179 aa  261  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  69.32 
 
 		 178 aa  251  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  48.82 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  48.21 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  49.41 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  49.41 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  49.41 
 
 		 182 aa  170  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  49.1 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  47.65 
 
 		 182 aa  169  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  46.43 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  49.67 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  44.64 
 
 		 174 aa  157  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  44.31 
 
 		 176 aa  157  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  42.26 
 
 		 174 aa  157  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  41.42 
 
 		 176 aa  149  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  39.53 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  40.35 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  34.5 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  42.41 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  37.85 
 
 		 191 aa  116  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  35.09 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  36.31 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  38.31 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  33.76 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  34.87 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  34.55 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  35.26 
 
 		 191 aa  99  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  33.76 
 
 		 196 aa  97.4  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  32.48 
 
 		 196 aa  94.7  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.33 
 
 		 191 aa  92.4  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  31.58 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  31.37 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  28.85 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  32.05 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  29.41 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0466  50S ribosomal protein L6  29.03 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  28.76 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  30.72 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  29.3 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  32.72 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  27.45 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  28.76 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  30.32 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  31.17 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  29.75 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  29.27 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  29.56 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_431  ribosomal protein L6P/L9E  28.39 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000303556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  31.41 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  28.39 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  27.74 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0264  50S ribosomal protein L6  29.55 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000279479  hitchhiker  0.0041278 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  28.66 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  30.77 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  28.57 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  27.63 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  27.1 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  28.4 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3428  50S ribosomal protein L6  27.74 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  29.55 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  28.85 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0775  ribosomal protein L6  30.38 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  29.56 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  26.75 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  27.74 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  28.29 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  27.74 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  27.56 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  28.22 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  26.75 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  29.22 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  27.1 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  29.22 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  27.92 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  28.03 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  27.1 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  29.03 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3462  50S ribosomal protein L6  28.79 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000287307  decreased coverage  0.00473222 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  30 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  27.92 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  27.27 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  25.16 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  27.45 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  26.45 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  29.94 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  26.97 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3493  50S ribosomal protein L6  28.79 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3761  50S ribosomal protein L6  28.79 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0024508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1939  50S ribosomal protein L6  28.79 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0207492  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  28.79 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3789  50S ribosomal protein L6  28.79 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  28.75 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3154  50S ribosomal protein L6  28.79 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0206863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>