More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0580 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 174 aa  350  5e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  66.47 
 
 		 174 aa  244  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  61.85 
 
 		 176 aa  218  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  59.88 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  52.05 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  52.05 
 
 		 176 aa  193  9e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  52.41 
 
 		 174 aa  187  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  49.42 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  46.2 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  47.37 
 
 		 182 aa  170  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  46.2 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  46.2 
 
 		 182 aa  167  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  46.2 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  44.64 
 
 		 177 aa  157  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  51.75 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  43.45 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  43.03 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  41.07 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  40.83 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  39.88 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  39.08 
 
 		 181 aa  127  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  44.16 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  36.81 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  38.1 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  36.13 
 
 		 205 aa  117  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  37.57 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  35.43 
 
 		 191 aa  114  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.31 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  38.85 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  36.94 
 
 		 196 aa  107  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  36.31 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  34.39 
 
 		 196 aa  98.2  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  32 
 
 		 192 aa  90.9  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  36.24 
 
 		 177 aa  87.4  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  36.25 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  34.18 
 
 		 182 aa  84.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  34.32 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  35.9 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  34.01 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  36.55 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  35.26 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  33.97 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  34.48 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  35.44 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  32.69 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  34.01 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  32.69 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  34 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  34.01 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  34.62 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0775  ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  34.94 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  36.99 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  33.1 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  32.05 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  39.04 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  39.04 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  31.97 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  34.62 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  38.78 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  32.69 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  34.46 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  32.69 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  32.65 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27601  Plastid ribosomal protein L6 large ribosomal subunit  36.2 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.935341  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  32.05 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  31.41 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  32.76 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  36.49 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  32.05 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  32.05 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  33.1 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  36.84 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  34.78 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  31.41 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  34.48 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  33.1 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  31.29 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  34.46 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  32.43 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  33.56 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  31.68 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  33.79 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  32.75 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  31.41 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  33.78 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  34 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  31.25 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  32.67 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  32.41 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  34.48 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  32.41 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  34.9 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  32.43 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>