More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1705 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 
196 aa  385  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  82.65 
 
 
196 aa  340  1e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  83.67 
 
 
196 aa  338  2e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  82.14 
 
 
196 aa  331  4e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  58.55 
 
 
195 aa  225  3e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  48.22 
 
 
191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  41.21 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  45.03 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  39.01 
 
 
182 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  38.46 
 
 
182 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  41.14 
 
 
174 aa  116  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  39.75 
 
 
176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  38.79 
 
 
174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  38.46 
 
 
182 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  40.12 
 
 
183 aa  112  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  45.61 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  38.85 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  35.36 
 
 
185 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  35.52 
 
 
176 aa  104  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  36.02 
 
 
179 aa  104  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  35.71 
 
 
182 aa  100  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  35.4 
 
 
177 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  36.46 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  33.14 
 
 
177 aa  99  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  35.96 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  33.7 
 
 
177 aa  97.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  33.76 
 
 
177 aa  97.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  34.29 
 
 
178 aa  95.5  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  34.95 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  32.14 
 
 
178 aa  92.8  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  39.47 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  31.46 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  30.77 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  35.76 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  36.42 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0335  50S ribosomal protein L6  31.95 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000198862  hitchhiker  0.000458858 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.26 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  33.55 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0264  50S ribosomal protein L6  34.21 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000279479  hitchhiker  0.0041278 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2617  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00663642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3154  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0206863  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  30.77 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3761  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0024508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  31.93 
 
 
179 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3493  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3789  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1939  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0207492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3731  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000218121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  32.9 
 
 
182 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0342  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157965  normal  0.0125773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2744  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000130297  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0291  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000875703  normal  0.0218003 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0282  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00574931  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0363  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000934657  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3462  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000287307  decreased coverage  0.00473222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  28.48 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  33.71 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  36.71 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  32.73 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  36.71 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  32.54 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  30.99 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3428  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  30.77 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  36.65 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  34.68 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2824  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0379678  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  33.55 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  33.55 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0490  50S ribosomal protein L6  30.77 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00133523  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0329  50S ribosomal protein L6  30.92 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00323508  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1037  50S ribosomal protein L6  32.89 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000958163  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  33.97 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3934  50S ribosomal protein L6  30.92 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  33.12 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf426  50S ribosomal protein L6  31.14 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3629  50S ribosomal protein L6  31.58 
 
 
176 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000298442  hitchhiker  0.0000000000176204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  29.34 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  36.09 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  29.7 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  32.89 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05795  50S ribosomal protein L6  34.68 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  29.7 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  34.71 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  32 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  30.67 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  28.99 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  32.24 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  28.21 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  31.43 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>