More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2237 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  61.85 
 
 
174 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  56.82 
 
 
176 aa  214  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  55.49 
 
 
174 aa  201  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  53.22 
 
 
177 aa  189  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 
174 aa  186  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  51.46 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  50.58 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  49.41 
 
 
182 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  48.21 
 
 
182 aa  170  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  48.82 
 
 
182 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  48.82 
 
 
182 aa  168  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  45.03 
 
 
178 aa  160  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  44.31 
 
 
177 aa  157  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  44.12 
 
 
178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  50.98 
 
 
183 aa  153  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  41.92 
 
 
177 aa  147  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  39.52 
 
 
179 aa  142  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  39.88 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  40.12 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  43.27 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  36.9 
 
 
205 aa  124  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  43.51 
 
 
191 aa  122  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  34.83 
 
 
191 aa  122  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  37.28 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  37.78 
 
 
195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  36.21 
 
 
191 aa  111  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.36 
 
 
191 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  34.64 
 
 
192 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  36.46 
 
 
196 aa  99.8  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  35 
 
 
196 aa  97.4  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  35 
 
 
196 aa  94  9e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  33.33 
 
 
196 aa  87.8  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  37.42 
 
 
177 aa  85.5  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  34.21 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  33.97 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  31.01 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  31.17 
 
 
177 aa  73.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  36.25 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  35.14 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  34.78 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  30.2 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  35.44 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  35.4 
 
 
178 aa  72  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  31.37 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  36.54 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  32.69 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  35.22 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  37.27 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  31.03 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  32.41 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  32.41 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  32.41 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  33.96 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  34.59 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  31.72 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  29.66 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  31.85 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  33.12 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  29.66 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  30.06 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  30.34 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  33.54 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  30.97 
 
 
177 aa  67.4  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  31.72 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  32.69 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  35.22 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  33.75 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  30.72 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  37.93 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  32.65 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  36 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  32.7 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  30.34 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  31.03 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  29.66 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  32.67 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  29.05 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  31.41 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  33.56 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  31.72 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  35.22 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  34.21 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  31.68 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  29.73 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  30.61 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  32.03 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  30.95 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  31.82 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  31.82 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  33.95 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  33.33 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  31.03 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  33.33 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  29.68 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>