More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0097 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  51.2 
 
 		 174 aa  193  9e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  52.41 
 
 		 174 aa  187  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  52.38 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  48.21 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  48.8 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  46.71 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  47.62 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  46.11 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  47.02 
 
 		 182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  47.02 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  47.31 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  49.67 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  41.92 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  41.24 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  43.71 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  39.53 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  41.46 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  35.47 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  40.11 
 
 		 191 aa  128  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  43.29 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  40.49 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  41.14 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  41.29 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  36.99 
 
 		 191 aa  110  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  39.47 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  38.46 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  38.46 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  34.78 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.08 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  32.62 
 
 		 205 aa  102  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  34.27 
 
 		 195 aa  101  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  31.25 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  34.62 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  35.26 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  31.68 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  33.56 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  31.06 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  34.97 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  34.97 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  34.97 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  34.97 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  34.97 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  32.16 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  34.97 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  34.97 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  31.33 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  34.97 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  33.74 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  34.36 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  30.67 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0305  50S ribosomal protein L6  33.76 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.9924900000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  33.12 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  29.19 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  29.81 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  29.81 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  31.52 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  30.77 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  30.97 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  29.81 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  33.74 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  28.57 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  29.66 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  29.81 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  30 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3744  50S ribosomal protein L6  29.33 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640948  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  31.47 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  30.12 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  29.45 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  28.67 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0214  50S ribosomal protein L6  28.67 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000010053  hitchhiker  0.00000000158568 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  31.25 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  29.03 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  30.77 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  30.07 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  34.39 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0214  50S ribosomal protein L6  28.67 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000958159  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0209  50S ribosomal protein L6  28.67 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000225303  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  31.85 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  29.19 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  30.67 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  30.77 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  30 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  28.76 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  30.77 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  29.66 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  32.9 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  30.77 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  29.66 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  31.91 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  31.06 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  29.03 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4041  50S ribosomal protein L6  28.67 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000805939  unclonable  0.00000000000307302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4155  50S ribosomal protein L6  28.67 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000600192  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  28.12 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  28.67 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0211  50S ribosomal protein L6  28.67 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>