287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00250 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  52.33 
 
 		 191 aa  195  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  52.31 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  52.75 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  44.72 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  38.2 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  37.57 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  35.42 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  37.29 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  36.72 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  37.14 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  36.36 
 
 		 178 aa  112  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  34.62 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  36.21 
 
 		 176 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  36.72 
 
 		 182 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  36.99 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  34.66 
 
 		 178 aa  108  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  32.22 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  42.54 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  33.9 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  36 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  36.57 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  34.46 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  35.26 
 
 		 177 aa  99  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  33.53 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  33.16 
 
 		 181 aa  98.2  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  30.51 
 
 		 178 aa  97.8  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  35.96 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  36.14 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  33.53 
 
 		 196 aa  93.6  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  35.29 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  34.68 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  33.91 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  33.55 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0335  50S ribosomal protein L6  30.92 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000198862  hitchhiker  0.000458858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  32.68 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  32.68 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3428  50S ribosomal protein L6  32.05 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  31.74 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5055  50S ribosomal protein L6  31.01 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0037225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  29.33 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  28.95 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  28.95 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  28.95 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  29.09 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0335  50S ribosomal protein L6  29.49 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000240759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0490  50S ribosomal protein L6  30.97 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00133523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2824  50S ribosomal protein L6  32.26 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0379678  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1037  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000958163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4228  50S ribosomal protein L6  32.26 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00495937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  27.63 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  28.81 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  30.67 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  28.95 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  31.85 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  28.85 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3934  50S ribosomal protein L6  32.03 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0616  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  29.87 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  29.3 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  30.26 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  28.85 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  28.85 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3629  50S ribosomal protein L6  32.26 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000298442  hitchhiker  0.0000000000176204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  29.38 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  28.85 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  28.1 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  29.61 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  31.61 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  29.49 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0329  50S ribosomal protein L6  30.97 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00323508  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  29.49 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  29.49 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  28.1 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  27.63 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  27.56 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  27.33 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  30 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  28.21 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  31.33 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  30 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  30.57 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  30.97 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  28 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0214  50S ribosomal protein L6  27.74 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000010053  hitchhiker  0.00000000158568 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  28.03 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  29.11 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3899  50S ribosomal protein L6  25 
 
 		 177 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0974  50S ribosomal protein L6  29.33 
 
 		 177 aa  51.6  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234587  hitchhiker  0.00000109608 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0298  50S ribosomal protein L6  25 
 
 		 177 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000138851  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  28.57 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  29.22 
 
 		 177 aa  51.6  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>