68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_45591 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009358  OSTLU_45591  Ribosomal protein L9, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 
191 aa  392  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0366824  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19025  predicted protein  53.12 
 
 
205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00250  60s ribosomal protein l9, putative  52.75 
 
 
191 aa  175  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85470  predicted protein  50 
 
 
191 aa  169  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.210117  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09465  60S ribosomal protein L9, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09100)  48 
 
 
192 aa  161  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0608  ribosomal protein L6  35.08 
 
 
191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00292124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0458  50S ribosomal protein L6P  36.67 
 
 
176 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0268307  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0580  50S ribosomal protein L6P  36.31 
 
 
174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.141728  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1762  ribosomal protein L6P  35.45 
 
 
181 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.34503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0017  50S ribosomal protein L6P  38.25 
 
 
177 aa  108  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  4.87132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0548  50S ribosomal protein L6P  34.46 
 
 
174 aa  108  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.329279  normal  0.17602 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0097  50S ribosomal protein L6P  34.08 
 
 
174 aa  105  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.609574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2237  50S ribosomal protein L6P  37.36 
 
 
176 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000185455  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1837  50S ribosomal protein L6P  35.87 
 
 
195 aa  102  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1712  ribosomal protein L6  35.59 
 
 
176 aa  101  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020525  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0226  ribosomal protein L6P  35.14 
 
 
179 aa  101  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1844  50S ribosomal protein L6P  32.4 
 
 
178 aa  98.2  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1400  50S ribosomal protein L6P  40.74 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0660  50S ribosomal protein L6P  36.22 
 
 
182 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.238102  hitchhiker  0.000992525 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0163  50S ribosomal protein L6P  36.22 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00284437  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2234  ribosomal protein L6P  33.15 
 
 
177 aa  95.1  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0107  50S ribosomal protein L6P  32.98 
 
 
181 aa  95.1  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000249213  unclonable  0.000000420842 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1505  ribosomal protein L6P  30.51 
 
 
178 aa  94.4  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.66484e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1258  50S ribosomal protein L6P  35.68 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.032606  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2433  50S ribosomal protein L6P  33.33 
 
 
177 aa  92.4  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0726  50S ribosomal protein L6P  33.69 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0094  50S ribosomal protein L6P  31.82 
 
 
177 aa  92  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000167517  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2308  50S ribosomal protein L6P  32.5 
 
 
178 aa  91.7  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0794  50S ribosomal protein L6  33.15 
 
 
185 aa  91.3  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.284303 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1705  50S ribosomal protein L6P  32.26 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0210193 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1514  50S ribosomal protein L6P  32.54 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.51305  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0608  50S ribosomal protein L6P  31.02 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000239568 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1576  50S ribosomal protein L6P  31.18 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000756586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  29.94 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  32.97 
 
 
178 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  28 
 
 
177 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  34.48 
 
 
178 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  33.73 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  33.33 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  28.03 
 
 
177 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  32.53 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  36.36 
 
 
182 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3428  50S ribosomal protein L6  30.19 
 
 
177 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  32.1 
 
 
187 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  26.67 
 
 
177 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  32.5 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  26.67 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  33.33 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1851  ribosomal protein L6  26.83 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.56126e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  32.18 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  32.1 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3934  50S ribosomal protein L6  30.07 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  29.68 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  31.58 
 
 
177 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  31.25 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  31.25 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  31.25 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  31.25 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  31.25 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  31.25 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  31.25 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  31.25 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  31.25 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  34.52 
 
 
177 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  28.66 
 
 
177 aa  42  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  30 
 
 
179 aa  41.6  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0352  50S ribosomal protein L6  34.07 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1839  50S ribosomal protein L6  34.07 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>