More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1851 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1851  ribosomal protein L6  100 
 
 
190 aa  377  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.56126e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  47.31 
 
 
178 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  46.24 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  43.85 
 
 
177 aa  160  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  44.39 
 
 
177 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  43.98 
 
 
184 aa  159  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  43.98 
 
 
184 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  42.25 
 
 
177 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  44.15 
 
 
184 aa  155  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0335  50S ribosomal protein L6  42.25 
 
 
177 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000240759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  41.71 
 
 
177 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  43.32 
 
 
177 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  44.09 
 
 
179 aa  154  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  42.63 
 
 
179 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  42.93 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  42.55 
 
 
180 aa  152  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00953  50S ribosomal protein L6  43.32 
 
 
177 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0734749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  39.04 
 
 
177 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0801  50S ribosomal protein L6  41.49 
 
 
183 aa  149  2e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00557608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  41.18 
 
 
177 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  43.32 
 
 
177 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3509  ribosomal protein L6  42.78 
 
 
177 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000396017  hitchhiker  0.00000010719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  44.39 
 
 
179 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  39.57 
 
 
177 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  42.02 
 
 
177 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  41.71 
 
 
177 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  41.71 
 
 
177 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  43.32 
 
 
176 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  41.71 
 
 
177 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  41.71 
 
 
177 aa  148  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  43.85 
 
 
177 aa  148  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4529  50S ribosomal protein L6  41.18 
 
 
177 aa  147  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000152303  hitchhiker  0.000162155 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0075  50S ribosomal protein L6  41.18 
 
 
177 aa  147  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0536854  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  43.32 
 
 
179 aa  147  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03156  50S ribosomal protein L6  40.11 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000273178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0408  ribosomal protein L6 signature 1  40.11 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03107  hypothetical protein  40.11 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000133235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3600  50S ribosomal protein L6  40.11 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00731053  normal  0.0167726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  40.11 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  42.31 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0408  50S ribosomal protein L6  40.11 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000304254  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  41.18 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  40.53 
 
 
179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3499  50S ribosomal protein L6  40.11 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3788  50S ribosomal protein L6  40.11 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000156973  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3690  50S ribosomal protein L6  40.11 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000170909  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  43.55 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4628  50S ribosomal protein L6  40.11 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000296835  normal  0.936677 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  43.55 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3621  50S ribosomal protein L6  39.57 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000291027  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3621  50S ribosomal protein L6  39.57 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0403056  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3694  50S ribosomal protein L6  39.57 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0880192  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3729  50S ribosomal protein L6  39.57 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0348679 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  43.68 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  42.47 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  39.57 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  43.55 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  40.11 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  44.09 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  42.25 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  44.15 
 
 
177 aa  145  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  40.88 
 
 
182 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  42.25 
 
 
176 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3986  50S ribosomal protein L6  40.64 
 
 
177 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0087686  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  39.36 
 
 
184 aa  145  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  43.09 
 
 
181 aa  145  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  40.64 
 
 
177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0598  50S ribosomal protein L6  40.64 
 
 
177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000013887  normal  0.735029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0298  50S ribosomal protein L6  40.64 
 
 
177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000138851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3899  50S ribosomal protein L6  40.64 
 
 
177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139368  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  42.25 
 
 
177 aa  144  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  41.18 
 
 
177 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  43.55 
 
 
178 aa  145  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  44.44 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  44.44 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  44.44 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  44.44 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  44.44 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  44.44 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  44.44 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  44.97 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  44.44 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3792  50S ribosomal protein L6  39.04 
 
 
177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3807  50S ribosomal protein L6  40.11 
 
 
177 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  43.32 
 
 
179 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  39.57 
 
 
177 aa  143  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  40.64 
 
 
176 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  43.92 
 
 
179 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  40.32 
 
 
180 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  38.5 
 
 
177 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  41.58 
 
 
182 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  39.57 
 
 
175 aa  143  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  41.71 
 
 
177 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  39.04 
 
 
177 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  42.11 
 
 
179 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0974  50S ribosomal protein L6  39.57 
 
 
177 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234587  hitchhiker  0.00000109608 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  39.57 
 
 
177 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0420  50S ribosomal protein L6  39.04 
 
 
177 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00669543  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  41.94 
 
 
177 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  39.47 
 
 
179 aa  142  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>