More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0489 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0489  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 182 aa  360  6e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000497907  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_431  ribosomal protein L6P/L9E  94.51 
 
 		 182 aa  344  3e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000303556  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0466  50S ribosomal protein L6  90.11 
 
 		 182 aa  331  4e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  53.85 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  54.12 
 
 		 183 aa  184  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  50.57 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 178 aa  180  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 181 aa  177  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 178 aa  177  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  51.69 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 182 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 180 aa  174  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  51.76 
 
 		 182 aa  174  8e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  50.57 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 178 aa  171  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 179 aa  170  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  48.86 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  169  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  50.57 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  47.16 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  51.12 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  46.78 
 
 		 182 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  51.18 
 
 		 182 aa  167  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  47.43 
 
 		 177 aa  168  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 179 aa  167  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 179 aa  167  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 181 aa  167  9e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  49.71 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 178 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 178 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  47.93 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  46.02 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 180 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  42.86 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 187 aa  160  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>