137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3813 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  62.84 
 
 
183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  48 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  44.08 
 
 
189 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  41.09 
 
 
157 aa  98.2  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  40.69 
 
 
168 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  46.92 
 
 
167 aa  94.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  42.66 
 
 
167 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  41.26 
 
 
178 aa  88.2  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  40.15 
 
 
180 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  38.99 
 
 
169 aa  87  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  43.97 
 
 
165 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  40.27 
 
 
160 aa  85.5  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  39.58 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  41.13 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  34.06 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  36.43 
 
 
165 aa  79  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  37.04 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  39.86 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  40.16 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  36.11 
 
 
171 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  35.14 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  30.83 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  38.67 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  32.35 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  45.63 
 
 
172 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  42.74 
 
 
160 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  30.83 
 
 
167 aa  62.8  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  33.08 
 
 
147 aa  61.6  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  33.09 
 
 
149 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  41.43 
 
 
170 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  30.08 
 
 
163 aa  59.3  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  37.41 
 
 
161 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  34.35 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  39.81 
 
 
125 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  35.94 
 
 
160 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  35.59 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  33.07 
 
 
149 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  37.17 
 
 
142 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  36.7 
 
 
163 aa  55.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  33.08 
 
 
158 aa  55.1  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  28.67 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  37.19 
 
 
133 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  32.85 
 
 
146 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  33.58 
 
 
135 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  30.71 
 
 
139 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  30.23 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  35.66 
 
 
143 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  37.04 
 
 
145 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  33.94 
 
 
136 aa  52.4  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  32.31 
 
 
137 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  28.57 
 
 
163 aa  51.6  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  31.97 
 
 
143 aa  51.6  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  37.88 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  35.34 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  33.59 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  35.58 
 
 
134 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  35.34 
 
 
135 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  35.56 
 
 
143 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2792  protein of unknown function DUF336  43.4 
 
 
167 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  29.85 
 
 
146 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  35.56 
 
 
143 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  33.59 
 
 
164 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  31.62 
 
 
137 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  30.88 
 
 
137 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  33.85 
 
 
150 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  33.06 
 
 
133 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  34.62 
 
 
134 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  36.61 
 
 
151 aa  48.5  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  33.02 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  31.3 
 
 
137 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  32.71 
 
 
121 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  37.84 
 
 
135 aa  48.5  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0533  hypothetical protein  34.41 
 
 
122 aa  48.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.773932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  34.02 
 
 
145 aa  48.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  34.82 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  35.14 
 
 
134 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  32.38 
 
 
132 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  32.67 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  31.3 
 
 
134 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  31.3 
 
 
134 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  34.86 
 
 
135 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  34.88 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  34.88 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  34.15 
 
 
145 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  41.79 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  36.11 
 
 
135 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  32.33 
 
 
142 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  34.38 
 
 
175 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  31.25 
 
 
159 aa  45.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  32.58 
 
 
132 aa  45.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  30.08 
 
 
139 aa  45.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  32.43 
 
 
135 aa  45.1  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  31.62 
 
 
144 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  32.69 
 
 
134 aa  44.7  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  33.05 
 
 
135 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>